Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRNP1Q6NT89 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRNP1Q6NT89 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRNP1Q6NT89 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms