Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCSAPQ6IQ19 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCSAPQ6IQ19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CCSAPQ6IQ19 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCSAPQ6IQ19 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms