Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATL3Q6DD88 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATL3Q6DD88 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATL3Q6DD88 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATL3Q6DD88 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ATL3Q6DD88 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATL3Q6DD88 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms