Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPECC1LQ69YQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SPECC1LQ69YQ0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPECC1LQ69YQ0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms