Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DUPD1Q68J44 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DUPD1Q68J44 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DUPD1Q68J44 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms