Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RNF123Q5XPI4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RNF123Q5XPI4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC31■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
RNF123Q5XPI4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms