Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CHIC1Q5VXU3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CHIC1Q5VXU3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC40.17■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC40.16■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC40.15■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.14■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
CHIC1Q5VXU3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.11■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CHIC1Q5VXU3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.2 ms