Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXT5

SYPL2, Synaptophysin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL2Q5VXT5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYPL2Q5VXT5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SYPL2Q5VXT5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms