Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXM1

CDCP2, CUB domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP2Q5VXM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDCP2Q5VXM1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCP2Q5VXM1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDCP2Q5VXM1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCP2Q5VXM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCP2Q5VXM1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDCP2Q5VXM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDCP2Q5VXM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDCP2Q5VXM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCP2Q5VXM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1190.8 ms