Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM46CQ5VWP2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM46CQ5VWP2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FAM46CQ5VWP2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms