Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM4

PRAMEF8, PRAME family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF8Q5VWM4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRAMEF8Q5VWM4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRAMEF8Q5VWM4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRAMEF8Q5VWM4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms