Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GFI1BQ5VTD9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GFI1BQ5VTD9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GFI1BQ5VTD9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms