Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF220Q5VTB9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF220Q5VTB9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF220Q5VTB9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms