Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMEM164Q5U3C3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM164Q5U3C3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM164Q5U3C3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms