Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LGSNQ5TDP6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LGSNQ5TDP6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LGSNQ5TDP6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms