Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDZK1Q5T2W1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PDZK1Q5T2W1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDZK1Q5T2W1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
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