Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FRMPD1Q5SYB0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FRMPD1Q5SYB0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
FRMPD1Q5SYB0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
FRMPD1Q5SYB0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
FRMPD1Q5SYB0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms