Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HP1BP3Q5SSJ5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms