Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP188Q5SRE5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
NUP188Q5SRE5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
NUP188Q5SRE5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NUP188Q5SRE5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms