Protein–RNA interactions for Protein: Q5R3I4

TTC38, Tetratricopeptide repeat protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC38Q5R3I4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TTC38Q5R3I4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TTC38Q5R3I4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TTC38Q5R3I4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms