Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EMC4Q5J8M3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EMC4Q5J8M3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EMC4Q5J8M3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms