Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C9orf116Q5BN46 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf116Q5BN46 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms