Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB6CQ53S08 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB6CQ53S08 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB6CQ53S08 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms