Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LRRC23Q53EV4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LRRC23Q53EV4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms