Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9B1Q4ZJI4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9B1Q4ZJI4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9B1Q4ZJI4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9B1Q4ZJI4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9B1Q4ZJI4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9B1Q4ZJI4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9B1Q4ZJI4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC9B1Q4ZJI4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC9B1Q4ZJI4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC9B1Q4ZJI4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9B1Q4ZJI4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9B1Q4ZJI4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9B1Q4ZJI4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9B1Q4ZJI4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC9B1Q4ZJI4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9B1Q4ZJI4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9B1Q4ZJI4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC9B1Q4ZJI4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms