Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCT1

ZNF260, Zinc finger protein 260, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF260Q3ZCT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ZNF260Q3ZCT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ZNF260Q3ZCT1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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