Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXY7

LRIT3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT3Q3SXY7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LRIT3Q3SXY7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LRIT3Q3SXY7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRIT3Q3SXY7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRIT3Q3SXY7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms