Protein–RNA interactions for Protein: Q31612

HLA-B, HLA class I histocompatibility antigen, B-73 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-BQ31612 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-BQ31612 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HLA-BQ31612 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HLA-BQ31612 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HLA-BQ31612 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms