Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VWC2Q2TAL6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VWC2Q2TAL6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VWC2Q2TAL6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VWC2Q2TAL6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms