Protein–RNA interactions for Protein: Q2NL82

TSR1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR1Q2NL82 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSR1Q2NL82 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TSR1Q2NL82 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TSR1Q2NL82 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms