Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC96Q2M329 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC96Q2M329 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC96Q2M329 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms