Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KNOP1Q1ED39 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNOP1Q1ED39 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
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