Protein–RNA interactions for Protein: Q1A5X7

WHAMMP3, Putative WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHAMMP3Q1A5X7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
WHAMMP3Q1A5X7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
WHAMMP3Q1A5X7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WHAMMP3Q1A5X7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms