Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDO1Q16878 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDO1Q16878 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDO1Q16878 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
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