Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDK4Q16654 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PDK4Q16654 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDK4Q16654 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDK4Q16654 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
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