Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms