Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
NFIL3Q16649 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFIL3Q16649 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NFIL3Q16649 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
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