Protein–RNA interactions for Protein: Q16623

STX1A, Syntaxin-1A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1AQ16623 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STX1AQ16623 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1AQ16623 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
STX1AQ16623 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1AQ16623 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
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