Protein–RNA interactions for Protein: Q16568

CARTPT, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARTPTQ16568 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CARTPTQ16568 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CARTPTQ16568 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CARTPTQ16568 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 823.4 ms