Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA4Q16363 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA4Q16363 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LAMA4Q16363 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LAMA4Q16363 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
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