Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CNGA3Q16281 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGA3Q16281 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNGA3Q16281 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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