Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NPTX1Q15818 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NPTX1Q15818 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPTX1Q15818 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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