Protein–RNA interactions for Protein: Q15782

CHI3L2, Chitinase-3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L2Q15782 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHI3L2Q15782 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CHI3L2Q15782 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CHI3L2Q15782 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms