Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SKIV2LQ15477 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SKIV2LQ15477 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SKIV2LQ15477 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SKIV2LQ15477 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms