Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPS6KA1Q15418 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RPS6KA1Q15418 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA1Q15418 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA1Q15418 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPS6KA1Q15418 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms