Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
PTPRKQ15262 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PTPRKQ15262 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PTPRKQ15262 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PTPRKQ15262 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PTPRKQ15262 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms