Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRD3Q15059 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRD3Q15059 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD3Q15059 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD3Q15059 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
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