Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNX17Q15036 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNX17Q15036 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX17Q15036 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX17Q15036 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
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