Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NFIXQ14938 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NFIXQ14938 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NFIXQ14938 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NFIXQ14938 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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