Protein–RNA interactions for Protein: Q14690

PDCD11, Protein RRP5 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD11Q14690 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PDCD11Q14690 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCD11Q14690 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD11Q14690 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms