Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EBI3Q14213 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
EBI3Q14213 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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